应用软件 | vasp_6.3.2

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应用介绍

VASP 全称 Vienna Ab-initio Simulation Package，是维也纳大学 Hafner 小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。它是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。
VASP支持CPU多节点并行计算，也支持GPU加速计算。

使用指南

平台安装有CPU/GPU等多个支持并行计算的vasp版本，各版本在使用方法上大同小异。vasp在平台的安装路径一般为 /opt/app/vasp/版本号 和 /opt/app/vasp/版本号_gpu ，本文主要以 vasp 6.3.2 版本作演示。
一般 vasp 的 gpu 加速效果并不明显，建议用户申请多个CPU节点并行计算，或单个胖节点运行。
用户如果没有平台作业提交的经验，可以先查看帮助中心 - 作业系统部分，了解作业提交的基本概念和操作方法。

准备输入文件

下载如下附件，并上传到平台个人目录下，并解压。
vasp.demo.zip

提交CPU版本作业

在 vasp.demo 目录下创建作业脚本run.sh，内容如下：

#!/bin/bash

#SBATCH --job-name="vasp_cpu"
#SBATCH --nodes=2
#SBATCH --ntasks-per-node=12

source /opt/intel/oneapi/setvars.sh
export PATH=$PATH:/opt/app/vasp/6.3.2

mpirun vasp_std

提交GPU版本作业

在 vasp.demo 目录下创建作业脚本run.sh，内容如下：

#!/bin/bash

#SBATCH --job-name="vasp_gpu"
#SBATCH --partition=gpu
#SBATCH --nodes=2
#SBATCH --ntasks-per-node=12
#SBATCH --gres=gpu:1

source /opt/intel/oneapi/setvars.sh
module load /opt/app/nvidia/nvhpc/modulefiles/nvhpc/22.7
export PATH=$PATH:/opt/app/vasp/6.3.2_gpu

mpirun vasp_std

常见问题

有一些版本的VASP，如果节点上还有别的作业在运行，会报MPI错误的情况，这时需要在脚本中加入如下参数将作业运行模式设置为独占模式。

   #SBATCH --exclusive

在这种情况下，作业将独占整个节点，不与其他作业共享资源。这意味着，只有该作业可以在节点上运行，其他作业无法与之共享节点的 CPU、内存、GPU 等资源。
需要注意的是，使用 --exclusive 选项时，为了避免浪费资源，请将节点的资源申请满。比如节点是24核的，则将--ntask-per-node设置为24。