应用介绍

MATLAB（矩阵实验室）是MATrix LABoratory的缩写，是一款由美国 MathWorks 公司出品的商业数学软件。MATLAB是一种用于算法开发、数据可视化、数据分析以及数值计算的高级技术计算语言和交互式环境。MATLAB主要用于数值运算，但利用为数众多的附加工具箱（Toolbox）它也适合不同领域的应用，例如控制系统设计与分析、图像处理、信号处理与通讯、金融建模和分析等。

使用指南

可以采用两种方式使用Matlab，通过创建实例运行MATLAB或是在集群中提交作业。
在实例下，可以采用命令行或者图形化桌面提交计算，只能单机运行。
在集群中，通过用命令行或页面方式提交作业，可以并行计算。

通过实例运行

控制台

创建并运行实例后，点击控制台 terminal_icon 按钮，进入终端界面。在命令行输入如下命令：

/opt/app/MATLAB/bin/matlab

输出类似如下信息，即可正常用命令行使用Matlab。

MATLAB is selecting SOFTWARE OPENGL rendering.

                              < M A T L A B (R) >
                    Copyright 1984-2016 The MathWorks, Inc.
                     R2016b (9.1.0.441655) 64-bit (glnxa64)
                               September 7, 2016


To get started, type one of these: helpwin, helpdesk, or demo.
For product information, visit www.mathworks.com.

远程桌面

创建并运行实例后，在”工作台”中，找到Matlab实例，点击实例数据图标

点击上传，将本机的文件传输到实例中。

点击“远程桌面”进入实例，MATLAB会自动启动。

在左边”Current Folder“中可以看到刚刚上传的文件，此处以abcd.m为例，打开文件进行计算。计算输出的结果存储在同一个目录下，可以进一步进行处理。

在集群中并行计算

命令行方式

工作台中找到”public_cluster”集群，点击实例数据图标，将文件和数据上传到该集群的目录下。

点击进入控制台界面。

在命令行输入vi matlab_demo.sh创建matlab_demo.sh脚本，示例内容如下：

#!/bin/bash

### 设置该作业的作业名
#SBATCH --job-name=test-matlab

## 指定该作业需要2个节点数
#SBATCH --nodes=2

### 每个节点所运行的进程数为20
#SBATCH --ntasks-per-node=20

### 作业最大的运行时间，超过时间后作业资源会被SLURM回收
#SBATCH --time=2:00:00

### 程序的执行命令
/opt/app/matlab-2022a/bin/matlab -nodesktop -nosplash -nodisplay -sd $HOME -r abcd -logfile LogFile.txt
echo "Matlab job ${SLURM_JOB_ID} done."

注意 : 上述MATLAB执行程序的路径以实际情况为准，通常安装在/opt/app/目录下。

或是参考数据上传，在本机创建好运行脚本后，通过WEB页面上传到集群的个人目录下。

Slurm作业脚本准备好后，在终端执行sbatch matlab_demo.sh命令来提交作业。作业完成后将在目录下生成testR.mat文件，可以将此文件下载后再参考上文，上传到 MATLAB 单机的图形界面中进行处理。

或是通过控制台，直接从集群目录将文件复制到MATLAB实例目录下。

打开实例的终端，输入如下命令复制文件：

cp /groups/public_cluster/home/demo_user/file ~/

注意，其中public_cluster修改为公共集群名称，demo_user更改为自己的用户名，file为文件名称。

也可以参考集群登录通过客户端创建并运行脚本。

WEB页面方式

除了命令行方式，可以通过WEB页面建立和提交作业。

进入到“集群”的“提交作业”页面，选择集群，选择模板，设定脚本名称，参照命令行模式中matlab_demo.sh脚本内容，将MATLAB执行命令粘贴到下面的“脚本”框中，并点击“提交作业”。

作业完成后，会在集群目录下生成testR.mat文件。

参考上文将文件拷贝到带图形的MATLAB单机实例中进行阅览。

更多资料

测试用例abcd.m的内容

% The user's MATLAB codes
A = zeros(100,1);
parfor i = 1:100
    pause(10);
    A(i) = i;
    %A(i) = sin(i*2*pi/20);
end
save testR.mat A; %save result