应用介绍

Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版，支持Linux、Mac、 Windows系统以及Python、R等科学计算语言，提供了包（Package）管理与环境（Environment）管理的功能，可以很方便地解决多版本多环境并存的问题。用户可以为某项具体的任务创建单独的环境，环境之间相互隔离。这样可以避免同一环境中各类软件相互冲突的问题。Anaconda利用conda命令来进行包和环境的管理，并且已经包含了Python和相关的配套工具。

因为Conda支持多虚拟环境，建议用户使用Anaconda来管理和使用各类应用。

使用指南

默认环境和软件源

平台已经默认安装了anaconda3应用，并内置了一些常见软件环境，安装路径为：/opt/app/anaconda3
用户可以通过配置环境变量，使用平台提供的anaconda3，需要在~/.bahsrc文件中添加命令：export PATH=/opt/app/anaconda3/bin:$PATH ，添加完成后，运行命令source ~/.bashrc，使配置的环境变量生效。
Anaconda默认的软件源在国外，速度比较慢，可以将其更换为清华源，详见清华大学开源软件镜像站的说明。

环境管理

在使用Anaconda时，默认环境是base，base环境中提供了一些基础的工具，用户可以直接使用。如果默认的base环境没有用户需要的软件，用户也可以创建自己的环境，并进行安装。

1. 创建新环境

操作命令： conda create --name env_name package_names

env_name 是创建的环境名称。建议以英文命名，且不加空格。
package_names 是安装在环境中的软件包名称。如果要在新建的环境中安装多个包，需要使用空格将各个包名隔开。例如，创建一个名为py37的环境，环境中安装版本为3.7的python，同时安装包numpy和pandas：

conda create --name py37 python=3.7 numpy pandas
新的环境以及环境内的包会被安装到/home/用户名/.conda/envs/目录下。

2. 切换环境

操作命令： source activate env_name

比如切换到新建的py37环境，需要执行命令： source activate py37
如果需要退出环境，则执行命令： conda deactivate 。退出新建环境后，默认会切换到base环境。

3. 复制环境

操作命令： conda create --name new_env_name --clone old_env_name

new_env_name 为复制的新环境名称，old_env_name 为原有的环境名称。
由于conda不支持重命名环境，如果要重命名，可以通过先复制一个新环境，再删除原来环境。

4. 显示环境

操作命令： conda info --envs 、conda env list

5 删除环境

操作命令： conda remove --name env_name --all

env_name 是被删除环境的名称。

软件包管理

1. 获取当前环境中已安装的软件包信息

操作命令： conda list

2. 在指定环境中安装软件包

操作命令： conda install --name env_name package_name

env_name 是指定的环境名。
package_name 是指定的包名。
如果不加-name env_name，则安装到当前所在的环境。

3. 卸载软件包

操作命令： conda remove -n env_name package_name

env_name 是指定的环境名。
package_name 是指定的包名。
如果不加-name env_name，则卸载当前所在的环境的软件包。

命令参考

操作命令	说明
`conda –V`	查看conda版本
`conda –h`	查看conda帮助
`conda update conda`	更新conda
`conda create --name`	使用conda创建新的环境
`source activate`	激活创建的环境
`conda info --envs`	显示已创建的环境
`conda create --name --clone`	复制环境
`deactivate`	退出环境
`conda remove --name --all`	删除环境
`conda install --name`	在指定环境中安装包
`conda list`	列出已安装的包
`conda update`	更新当前环境中的安装包
`conda remove`	移除当前环境中的安装包
`conda remove -n`	移除指定环境中的安装包

常见问题

问题1：

如果多个用户需要协同使用一个环境，可以由某一个用户指定共享目录创建环境，供其他用户使用。

操作命令： conda create -p /home/share/a/env_name package_name

比如，用户a想要创建一个包含r-base的环境，并共享给用户b使用。则用户a可以运行命令：conda create -p /home/share/a/r-base r-base，并赋予用户b对 /home/share/a/r-base目录的可读权限。用户b再运行命令 conda activate /home/share/a/r-base ，即可共享使用这个环境。

问题2

由于公共集群登陆节点（workstation）有内存限制，无法运行占用内存资源的操作，需要申请计算节点运行conda。
例如，需要在个人目录创建conda环境时，可以这样操作：
1.运行【salloc】命令，获得计算资源
2.运行【ssh cpuxx】命令，登陆到cpuxx计算节点
3.运行【source /opt/app/anaconda3/bin/activate】命令，进入公共集群conda的base环境
4.运行【conda create -n my_env】命令，创建名为【my_env】的个人环境